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原虫是单细胞动物，整个虫体由1个细胞构成。分类上属于原生生物界，原生动物亚界。同高等动物的细胞一样，原虫具有细胞膜、细胞质和细胞核等主要细胞结构。在光电显微镜下，原虫细胞核外表变化很大，除纤毛虫外，中兽医厂家，大多数均为囊泡状，其特征为染色质分布不均匀，在核液中出现明显的清亮区，染色质浓缩于细胞核的周围区域或中央区域。有1个或多个核仁。核内体明显，与核仁相似，但在有丝分裂过程中不消失。

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可根据本地区该病的流行情况、患病牛的临床症状进行初步诊断，但伊氏锥虫的确诊需进行实验室检测。实验室检测伊氏锥虫的方法有：压片镜检、血液涂片、试管采虫检验和毛细管集虫检验等病原检测；补体结合试验、乳胶凝集试验、对流免yi电泳和ELISA等检测方法；也可进行小鼠、家兔等试验动物接种试验。

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鸡组织滴虫病，病鸡盲肠、肝呈现特殊病理特征，病鸡的盲肠壁肥厚，内有炎性栓塞物，大量栓塞物致使肠管畸形，久病鸡只盲肠内栓塞物出现干酪样变化。肝轻微肿大，上有黄色宽条纹，严重鸡只出现黄dan，肝表面出现大小不等的溃疡灶，溃疡灶中间塌陷、四周隆起，似火山口状，中心处有少许浓液。有些病鸡心肌出现松弛柔软，当鸡群出现败血型大肠杆菌继发感媣时，有心包炎、肝周炎、腹膜炎等症状。